Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ssxb10Q6XAR7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ssxb10Q6XAR7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ssxb10Q6XAR7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ssxb10Q6XAR7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ssxb10Q6XAR7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ssxb10Q6XAR7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Ssxb10Q6XAR7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ssxb10Q6XAR7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ssxb10Q6XAR7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Ssxb10Q6XAR7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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