Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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