Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RhoP15409 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhoP15409 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhoP15409 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhoP15409 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RhoP15409 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhoP15409 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhoP15409 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RhoP15409 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms