Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbip1J3QMK2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms