Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933424G06RikA0A140LIP3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms