Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
1700019A02RikA0A087WPV9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700019A02RikA0A087WPV9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms