Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Subh2bvQ9D9Z7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms