Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gadd45gip1Q9CR59 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gadd45gip1Q9CR59 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms