Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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NipblQ6KCD5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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NipblQ6KCD5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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NipblQ6KCD5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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NipblQ6KCD5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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NipblQ6KCD5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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NipblQ6KCD5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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NipblQ6KCD5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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NipblQ6KCD5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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NipblQ6KCD5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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