Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdc1Q5PSV9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mdc1Q5PSV9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.1 ms