Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnga1P29974 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms