Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms