Protein–RNA interactions for Protein: D3YXG0

Hmcn1, Hemicentin-1, mousemouse

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Length 5,634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn1D3YXG0 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Hmcn1D3YXG0 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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Hmcn1D3YXG0 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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Hmcn1D3YXG0 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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Hmcn1D3YXG0 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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Hmcn1D3YXG0 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hmcn1D3YXG0 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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Hmcn1D3YXG0 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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