Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PtprmP28828 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PtprmP28828 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Mir539-201ENSMUST00000102109 74 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Mir192-201ENSMUST00000083589 89 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PtprmP28828 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
PtprmP28828 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PtprmP28828 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PtprmP28828 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm26307-201ENSMUST00000157767 126 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Gm25995-201ENSMUST00000175396 142 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Mir6395-201ENSMUST00000183885 91 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PtprmP28828 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm37646-201ENSMUST00000191756 111 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm23066-201ENSMUST00000158237 71 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PtprmP28828 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PtprmP28828 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
PtprmP28828 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm24016-201ENSMUST00000157726 68 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm22573-201ENSMUST00000082982 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PtprmP28828 Gm24631-201ENSMUST00000122765 81 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PtprmP28828 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PtprmP28828 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PtprmP28828 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.22□□□□□ -2.93
PtprmP28828 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PtprmP28828 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PtprmP28828 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PtprmP28828 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PtprmP28828 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PtprmP28828 Mir28c-201ENSMUST00000200096 75 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PtprmP28828 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PtprmP28828 Gm22602-201ENSMUST00000157596 95 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm23811-201ENSMUST00000175155 84 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PtprmP28828 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PtprmP28828 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.5 ms