RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7
Cldn9, Claudin-9, mouse
Predictions only
Length
217 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Cldn9
Q9Z0S7
Mir466h-201
ENSMUST00000104748
81 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23904-201
ENSMUST00000157567
124 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23722-201
ENSMUST00000083002
130 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
Cldn9
Q9Z0S7
Gm28724-201
ENSMUST00000186149
625 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm37746-201
ENSMUST00000193249
198 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Snord45b-201
ENSMUST00000082797
71 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24717-201
ENSMUST00000157522
124 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25370-201
ENSMUST00000158159
94 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm27694-201
ENSMUST00000184740
86 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24704-201
ENSMUST00000093715
107 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25623-201
ENSMUST00000157216
108 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24580-201
ENSMUST00000103965
131 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25887-201
ENSMUST00000157777
84 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24106-201
ENSMUST00000175498
127 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26233-201
ENSMUST00000175530
70 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Mir6961-201
ENSMUST00000183874
67 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Snord47-201
ENSMUST00000083034
77 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23507-201
ENSMUST00000083078
107 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24336-201
ENSMUST00000104203
146 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24842-201
ENSMUST00000158681
54 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24697-201
ENSMUST00000083881
107 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22319-201
ENSMUST00000157147
122 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Mir7015-201
ENSMUST00000199525
64 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm44853-201
ENSMUST00000209070
250 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm45492-201
ENSMUST00000211611
288 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
mt-Tn-201
ENSMUST00000082399
71 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Snord78-201
ENSMUST00000104032
66 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24377-201
ENSMUST00000104398
131 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22681-201
ENSMUST00000083853
106 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24108-201
ENSMUST00000175495
77 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Mir7055-201
ENSMUST00000197423
59 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26131-201
ENSMUST00000082725
110 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Mir677-202
ENSMUST00000197076
78 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm43977-201
ENSMUST00000203970
189 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm45429-201
ENSMUST00000209527
172 nt
BASIC
-1.26
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24714-201
ENSMUST00000102382
101 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25889-201
ENSMUST00000157775
107 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24947-201
ENSMUST00000158334
110 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22775-201
ENSMUST00000177630
120 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23569-201
ENSMUST00000180120
120 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm43324-201
ENSMUST00000197482
289 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22973-201
ENSMUST00000083298
191 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Snord57-201
ENSMUST00000083338
72 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Mir23a-201
ENSMUST00000083677
75 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25879-201
ENSMUST00000104330
107 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Mir7094-2-201
ENSMUST00000184622
60 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Mir7094-1-201
ENSMUST00000199671
60 nt
BASIC
-1.3
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25565-201
ENSMUST00000104605
105 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25622-201
ENSMUST00000157217
104 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24750-201
ENSMUST00000157843
104 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Mir6237-201
ENSMUST00000183808
91 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26092-201
ENSMUST00000179798
97 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Mir669a-1-201
ENSMUST00000180238
97 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24449-201
ENSMUST00000083985
106 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23494-201
ENSMUST00000116830
126 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23199-201
ENSMUST00000158812
107 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23864-201
ENSMUST00000177607
107 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24918-201
ENSMUST00000083022
130 nt
BASIC
-1.33
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Snord72-201
ENSMUST00000104549
81 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25978-201
ENSMUST00000158698
90 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24835-201
ENSMUST00000116777
111 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22558-201
ENSMUST00000157326
95 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24971-201
ENSMUST00000175581
110 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm43749-201
ENSMUST00000199345
352 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Snord64-201
ENSMUST00000104003
67 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22349-201
ENSMUST00000157864
107 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23216-201
ENSMUST00000179545
107 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22621-201
ENSMUST00000179678
74 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22055-201
ENSMUST00000083388
107 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm17522-202
ENSMUST00000186631
174 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm17412-202
ENSMUST00000189566
174 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Sult1c2-ps2-201
ENSMUST00000196414
276 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Vmn2r-ps50-201
ENSMUST00000209317
120 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm14837-201
ENSMUST00000119688
206 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26225-201
ENSMUST00000082508
135 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Traj53-201
ENSMUST00000103690
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm24263-201
ENSMUST00000104059
107 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
n-R5s155-201
ENSMUST00000122531
113 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23751-201
ENSMUST00000157583
136 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Gm19248-201
ENSMUST00000209404
110 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
Cldn9
Q9Z0S7
Mir466b-3-201
ENSMUST00000103806
81 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25010-201
ENSMUST00000158403
65 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Mir302c-201
ENSMUST00000083548
68 nt
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Mir1898-201
ENSMUST00000122643
83 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Gm22805-201
ENSMUST00000082739
107 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Mir369-201
ENSMUST00000083627
79 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
AC161426.1-201
ENSMUST00000214137
286 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
mt-Td-201
ENSMUST00000082404
70 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Mir3071-201
ENSMUST00000093621
80 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25425-201
ENSMUST00000157611
96 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Mir7673-201
ENSMUST00000184567
64 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Gm23477-201
ENSMUST00000158882
128 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Gm38298-201
ENSMUST00000193578
118 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
AC140930.2-201
ENSMUST00000221803
109 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26456-201
ENSMUST00000082831
111 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Gm26109-201
ENSMUST00000083970
70 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
Cldn9
Q9Z0S7
Gm42773-201
ENSMUST00000196962
148 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
Cldn9
Q9Z0S7
AC122335.1-201
ENSMUST00000217587
175 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
Cldn9
Q9Z0S7
Gm25410-201
ENSMUST00000083758
137 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
Cldn9
Q9Z0S7
Gm45125-201
ENSMUST00000206908
151 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
First
Previous
760
Next
Last
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms