Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SardhQ99LB7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms