Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BPC6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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