Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms