Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NipblQ6KCD5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NipblQ6KCD5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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