Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms