Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cct3P80318 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cct3P80318 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms