Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga1P29974 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga1P29974 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms