Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms