Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb3P09026 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms