Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col9a3A2ACT7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col9a3A2ACT7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms