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Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080
Snx16, Sorting nexin-16, mouse
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344 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Snx16
Q8C080
Gm26274-201
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm25056-201
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62 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm24009-201
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93 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm24686-201
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93 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm23340-201
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123 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm25693-201
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85 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm24463-201
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72 nt
BASIC
0.98
□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Mir22-201
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BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Snord35a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm25683-201
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131 nt
BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Snord69-201
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Vmn1r-ps69-201
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201 nt
BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm22466-201
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69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm38295-201
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BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
AC116319.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm26202-201
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65 nt
BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Mir500-201
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92 nt
BASIC
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□□□□□ -2.25
Snx16
Q8C080
Gm24271-201
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111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm22515-201
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305 nt
BASIC
0.96
□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm43206-201
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114 nt
BASIC
0.96
□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Olfr867-202
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4228 nt
TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm25506-201
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70 nt
BASIC
0.95
□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Snord71-201
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85 nt
BASIC
0.95
□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
B230307C23Rik-201
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192 nt
TSL 5
BASIC
0.95
□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm22030-201
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BASIC
0.95
□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm24549-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm23410-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm38323-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm22363-201
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm23814-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Mir30a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Mir448-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm24500-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm22140-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm26712-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Mir6380-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm38274-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm22805-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Mir27b-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Vmn1r75-202
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm26051-201
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm22679-201
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Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm24637-201
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm23301-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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Snx16
Q8C080
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Snx16
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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Snx16
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Gm21954-201
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Mir29a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
Mir216b-201
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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Snx16
Q8C080
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.26
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm24384-201
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BASIC
0.9
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Scarna3a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm22565-201
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69 nt
BASIC
0.9
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
AC211878.4-201
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262 nt
BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Mir377-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm25681-201
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BASIC
0.9
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm23528-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm22541-201
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BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Mir6342-201
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125 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Mir509-201
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75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm42506-201
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150 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm26441-201
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104 nt
BASIC
0.89
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm22677-201
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BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm24183-201
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BASIC
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□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
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BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
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BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm24208-201
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BASIC
0.88
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
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4741 nt
APPRIS P3
TSL 1 (best)
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm5581-201
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2550 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm23468-201
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108 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm24073-201
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106 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
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111 nt
BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
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BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm24527-201
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BASIC
0.87
□□□□□ -2.27
Snx16
Q8C080
Gm23853-201
ENSMUST00000158375
104 nt
BASIC
0.86
□□□□□ -2.27
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