Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Nedd9O35177 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Nedd9O35177 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Nedd9O35177 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Nedd9O35177 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Nedd9O35177 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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