Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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Hoxd10P28359 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Hoxd10P28359 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Hoxd10P28359 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.8 ms