Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Vpreb1P13372 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Vpreb1P13372 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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