Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Nedd9O35177 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Nedd9O35177 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Nedd9O35177 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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