Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Hoxd10P28359 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Hoxd10P28359 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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