Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm20473-201ENSMUST00000173064 112 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd11P23813 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Hoxd11P23813 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm22232-201ENSMUST00000104654 94 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd11P23813 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.5 ms