Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Vpreb1P13372 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Vpreb1P13372 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Vpreb1P13372 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Vpreb1P13372 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Vpreb1P13372 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Vpreb1P13372 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Vpreb1P13372 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Vpreb1P13372 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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