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Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0
Nicn1, Nicolin-1, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Nicn1
Q9CQM0
Gm23253-201
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104 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm24942-201
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114 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Scarna3a-201
ENSMUST00000158911
140 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm23714-201
ENSMUST00000179259
105 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm27699-201
ENSMUST00000183553
180 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Mir6390-201
ENSMUST00000184405
129 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm27587-201
ENSMUST00000185116
163 nt
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm36929-201
ENSMUST00000195152
166 nt
TSL 5
BASIC
0.64
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Olfr1100-202
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2937 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Mir1899-201
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96 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm24547-201
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149 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm25444-201
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113 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm22911-201
ENSMUST00000177920
107 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Ighv15-1-201
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276 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Mir30f-201
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92 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm23735-201
ENSMUST00000082551
134 nt
BASIC
0.63
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm26338-201
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110 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Snord69-201
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80 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm14946-201
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296 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm25329-201
ENSMUST00000158041
126 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm23760-201
ENSMUST00000158350
116 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Mir7657-201
ENSMUST00000196051
57 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm25138-201
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136 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Mir33-201
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69 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Mir216a-201
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72 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm22753-201
ENSMUST00000083657
107 nt
BASIC
0.62
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm26091-201
ENSMUST00000122704
82 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm24238-201
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98 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Mir3968-201
ENSMUST00000175355
100 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm27894-201
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92 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Mir7052-201
ENSMUST00000184821
65 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm24624-201
ENSMUST00000082617
164 nt
BASIC
0.61
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm25610-201
ENSMUST00000104016
129 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm16550-201
ENSMUST00000162550
126 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm28435-201
ENSMUST00000185496
108 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm28767-201
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114 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm44211-201
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145 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
CT485607.2-201
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91 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm25081-201
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108 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm6272-201
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171 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm26274-201
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321 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm26412-201
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55 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm24678-201
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104 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Snord33-201
ENSMUST00000083694
84 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
Nicn1
Q9CQM0
Gm25901-201
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130 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm23504-201
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95 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm36956-201
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214 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir196b-201
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85 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Olfr867-202
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4228 nt
TSL 3
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm23766-201
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80 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm23881-201
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66 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm12432-201
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186 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm23853-201
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104 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm24549-201
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139 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
CT009696.1-201
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256 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
DQ267101-201
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73 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir30a-201
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71 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir410-201
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81 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm5581-201
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2550 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm24246-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm25166-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm23416-201
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95 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir1954-201
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BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm27289-201
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82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm25820-201
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127 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Snord60-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm26301-201
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95 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm14626-201
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216 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Zfp969-202
ENSMUST00000131041
252 nt
TSL 2
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm22349-201
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107 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm25715-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm17528-201
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239 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm22466-201
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69 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir3109-201
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BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir3070a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm42935-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
AC124196.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
AC116319.1-201
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222 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
B230307C23Rik-201
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192 nt
TSL 5
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Trbv25-201
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273 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm26379-202
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132 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm43944-201
ENSMUST00000205220
120 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
AC159093.2-201
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297 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm24449-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm37824-201
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3236 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Zfp654-201
ENSMUST00000052588
4741 nt
APPRIS P3
TSL 1 (best)
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm24263-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir1191-201
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120 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm24141-201
ENSMUST00000122776
115 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm23857-201
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111 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir7663-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Gm27656-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
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BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir362-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Nicn1
Q9CQM0
Mir20b-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
Nicn1
Q9CQM0
Gm24579-201
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144 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
Nicn1
Q9CQM0
Gm25506-201
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70 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
Nicn1
Q9CQM0
Gm15289-201
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244 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
Nicn1
Q9CQM0
Gm24717-201
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BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
Nicn1
Q9CQM0
Gm26084-201
ENSMUST00000157903
104 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
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