Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Hoxd10P28359 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Hoxd10P28359 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Hoxd10P28359 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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