Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ctu2Q3U308 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ctu2Q3U308 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ctu2Q3U308 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms