Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpusd2Q149F1 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpusd2Q149F1 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpusd2Q149F1 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpusd2Q149F1 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpusd2Q149F1 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpusd2Q149F1 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpusd2Q149F1 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpusd2Q149F1 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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