Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Hoxd11P23813 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm24297-201ENSMUST00000158300 68 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Hoxd11P23813 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd11P23813 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd11P23813 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.2 ms