Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Vpreb1P13372 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Vpreb1P13372 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.6 ms