Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Hoxd10P28359 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Hoxd10P28359 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms