Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Vpreb1P13372 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Vpreb1P13372 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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