Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Rpusd2Q149F1 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm23293-201ENSMUST00000082552 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rpusd2Q149F1 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.2 ms