Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Perm1Q149B8 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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Perm1Q149B8 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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Perm1Q149B8 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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Perm1Q149B8 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Perm1Q149B8 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Perm1Q149B8 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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