Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Hoxd10P28359 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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Hoxd10P28359 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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Hoxd10P28359 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Hoxd10P28359 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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Hoxd10P28359 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Hoxd10P28359 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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