Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rpusd2Q149F1 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rpusd2Q149F1 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Rpusd2Q149F1 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm23237-201ENSMUST00000104639 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rpusd2Q149F1 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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