Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpc1Q9QZF2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms