Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms