Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot1Q6ZQ08 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms