Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc44a5Q5RJI2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc44a5Q5RJI2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms