Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim43aQ3TL54 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms